En la mañana del 2 de agosto, el monasterio fue tiroteado por cañones antiaéreos alemanes desde el cercano Pole Mokotowskie.
Después de una búsqueda superficial, que no condujo a encontrar ninguna prueba que apoyara estas acusaciones, los alemanes condujeron al superior del monasterio padre, Edward Kosibowicz, fuera del edificio, supuestamente para dar explicaciones adicionales en el mando.
Después de robarles valiosos objetos personales, todos fueron llevados a una pequeña habitación, que entonces había sido ocupada por el cochero del monasterio.
Cuando todos los polacos se reunieron en el sótano, los alemanes abrieron fuego con ametralladoras y les lanzaron granadas.
Junto con los muertos, los polacos gravemente heridos, que aún se encontraban en el lugar de la masacre, ardían vivos en ese momento.
[5] La última víctima de la masacre fue un capellán insurgente, el padre Franciszek Szymaniak SJ.
[9] "El coronel retirado Zołoteńko me dijo (...) que después de la ejecución en el monasterio le preguntó a uno de los alemanes qué había pasado con los sacerdotes del monasterio, y especialmente con el superior de la casa, a lo que recibió una respuesta en alemán: "Todos asesinados, dispararé a cada sacerdote de esta manera" - el testimonio del Padre Aleksander Kisiel.
Se desconoce el destino de la quinta persona, una mujer no identificada que regresó a Mokotów en busca de los niños que habían quedado en casa.
Cuando el comando llegó a Rakowiecka 61, convenció a sus compañeros de que en lugar de cargar los cuerpos y enterrarlos, era mejor emparedarlos en la habitación donde tuvo lugar la ejecución.
Esto más tarde facilitó la búsqueda y exhumación de cadáveres.
[14] Era visitada regularmente por los peregrinos que se dirigían al santuario de San Andrés Bobola.