Actualmente funciona como anexo del Museo de Arte Popular Griego.
La mezquita fue construida en 1759 por el gobernador (vaivoda) otomano de Atenas, Mustapha Agha Tzistarakis.
[1][2] La mezquita también se llamaba "Mezquita de la Fuente Baja" (Τζαμί του Κάτω Σιντριβανιού) o "Mezquita del Mercado Bajo" (Τζαμί του Κάτω Παζαριού) debido a su proximidad al Ágora de Atenas.
[2] En 1915 fue reconstruida parcialmente bajo la supervisión del arquitecto Anastasios Orlandos, y albergó el Museo de Manufactura Griego desde 1918 hasta 1973 (en 1923 se renombró Museo Nacional de Artes Decorativas).
[1][2] En 1973 las funciones principales del Museo de Arte Popular Griego se trasladaron al 17 de Kydathinaion, y la mezquita pasó a ser un anexo suyo.