Pertenece al Bloque Nacionalista Galego (BNG) y tomó posesión como alcalde del Ayuntamiento de Pontevedra en 1999.
Comenzó a gobernar en 1999, cuando su partido quedó como segunda fuerza en votos y empató con el PP en escaños.
En 2003 el BNG ganó las elecciones en votos pero volvió a empatar en escaños con el PP.
En junio de 2022 anunció su intención de repetir como candidato del BNG a unas nuevas elecciones municipales, con un proyecto a 8 o 10 años porque «lo que me motiva no es ver cosas que ya están en marcha, si no emprender o terminar otras nuevas».
Sin embargo, Fernández Lores pudo mantener la alcaldía renovando su pacto con el PSdeG.