Pero el 6809 fue también altamente optimizado, con una velocidad hasta 5 veces superior a las CPUs de la serie 6800.
Al igual que el 6800, incluyó la tristemente célebre e indocumentada instrucción de prueba de bus Halt and Catch Fire (HCF) (detener e incendiarse).
Un primer sufijo indicaba si el generador de reloj era interno o externo (E).
Debido a ello, los pines 39 (TSC / XTAL), 38 (LIC / EXTAL), 36 (AVMA / !MRDY) y 33 (BUSY / !DMA/!BREQ) son diferentes en los 6809E / 6809.
También pueden funcionar con FLEX y su versión mejorada XEX El Hitachi 6309 fue una versión mejorada del 6809 con más registros extra e instrucciones adicionales, incluyendo movimiento de bloques, instrucciones de multiplicación adicionales, y división implementada por hardware.
Tuvo muchas características innovadoras, varias de las cuales fueron copiadas y luego usadas en otras partes.
Actualmente NXP ofrece la familia de microcontroladores MC9S12 cuya arquitectura es muy parecida a la del 6809.