Tiene una extensión de 494.4 km² y se ubica al sureste de la entidad, limitando con los municipios de Santa María del Oro al norte, San Pedro Lagunillas al oeste, Jala e Ixtlán del Río al este y Amatlán de Cañas al sureste y sur.
La cabecera municipal lleva el mismo nombre (Ahuacatlán) que etimológicamente significa "lugar de aguacates" (del náhuatl āhuac- aguacate y -tlan 'lugar, sitio').
Uno de los personajes más importantes nacidos en este municipio es el padre del federalismo mexicano y fundador del estado de Jalisco, Prisciliano Sánchez, quien vio la primera luz el 4 de enero de 1783.
Predominan los climas cálido subhúmedo de humedad media y menor, por lo que es templado en la mayor parte del año y caluroso de marzo a agosto.
El temporal de lluvias se presenta durante el periodo julio-septiembre, con una precipitación media anual de 854.4 mm.