El Municipio de Magdalena Mixtepec es uno de los 570 municipios que integran el estado mexicano de Oaxaca.
Mixtepec es un nombre derivado de los vocablos del náhuatl; Mixtli, que quiere decir «nube» y Tepec que quiere decir «lugar en el cerro», por lo que Mixtepec significa «Cerro con neblina».