Su cabecera municipal es la ciudad homónima.
San Felipe presenta una serie de accidentes topográficos, ya que se ubica dentro de la mesa central o Altiplanicie Mexicana.
Su elevación más alta es la Sierra del Cubo, ésta es también, la sexta elevación más alta de todo el estado.
Extraordinariamente, el municipio cuenta con sus propios bosques, sin embargo, éstos son muy reducidos y se localizan cerca de las carreteras (como la carretera San Felipe-Silao), no se han visto muchos animales en esa zona, pero si toda clase de comunidades mayores de 500 habitantes.
Entre los principales atractivos turísticos se encuentran: La cabecera municipal (San Felipe) es la localidad más poblada del municipio, con 24 621 habitantes, seguida por San Bartolo de Berrios de 5250 habitantes.