Forma parte de la región Mixteca al noroeste del estado, su cabecera municipal es la población del mismo nombre.
Situado en el noroeste del territorio oaxaqueño, San Nicolás Hidalgo forma parte de la región Mixteca y del distrito de Silacayoapam.
Tiene una extensión territorial de solo 11.383 kilómetros cuadrados y sus coordenadas geográficas extremas son 17° 45' - 17° 48' de latitud norte y 98° 06' - 98° 10' de longitud oeste; su altitud va de 1 600 a 1 000 metros sobre el nivel del mar.
[1] La densidad de población asciende a un total de 88.9 personas por kilómetro cuadrado.
El municipio se encuentra formado por cuatro localidades.