Limita al norte con el municipio de Cuilápam de Guerrero, con el municipio de San Raymundo Jalpan, con el municipio de Santa Cruz Xoxocotlán, el municipio de Santa María Coyotepec y el municipio de San Bartolo Coyotepec; al este limita con el municipio de Santo Tomás Jalieza y al sureste con el municipio de San Martín Tilcajete; al sur sus límites corresponden a una segunda sección del municipio de San Bartolo Coyotepec, al municipio de Ciénega de Zimatlán y al municipio de Trinidad Zaachila; finalmente, al suroeste su límite corresponde al municipio de Santa Inés del Monte y al oeste al municipio de San Pablo Cuatro Venados.
[1] La densidad de población asciende a un total de 417.42 personas por kilómetro cuadrado.
El gobierno le corresponde al ayuntamiento, conformado por el presidente municipal, un síndico y el cabildo integrado por cuatro regidores.
Todos son electos mediante voto universal, directo y secreto para un periodo de tres años que pueden ser renovables para un periodo adicional inmediato.
Para la elección de diputados locales al Congreso de Oaxaca y de diputados federales a la Cámara de Diputados federal, el municipio de Villa de Zaachila se encuentra integrado en los siguientes distritos electorales: Local: Federal: