El edificio fue bombardeado durante la Segunda Guerra Mundial, por lo que los objetos que no se perdieron fueron trasladados a Nicópolis, donde se construyó un edificio para el museo a partir de 1965, que abrió al público en 1972.
Posteriormente, un nuevo museo se empezó a construir en 1999 y fue abierto al público en julio de 2009.
Se estructura en torno a tres unidades temáticas: la batalla de Accio, las infraestructuras de la ciudad en época romana y la evolución durante las épocas de los primitivos cristianos y el Imperio bizantino.
La sala B se centra en aspectos de la vida de los habitantes de la ciudad tales como sus actividades productivas y comerciales, su vida cotidiana y sus usos funerarios.
Aquí se exponen recipientes de cerámica, herramientas, joyas, juguetes, sarcófagos y objetos de uso cotidiano.