Sus orígenes se remontan al concierto histórico promovido por la Sociedad Musical Romana en mayo de 1889, durante el cual se tocaron instrumentos antiguos.
Cinco de ellos fueron donados a la Academia y se exhiben en el Museo.
Entre los instrumentos más importantes de la colección se encuentra el violín conocido como "Toscano" fabricado por Antonio Stradivari en 1690 junto con otros cuatro instrumentos que forman el denominado "quinteto Mediceo",[4] creado especialmente para el gran príncipe Ferdando de Médici También se encuentra la viola de David Tecchler, un lutier de origen alemán que trabajó a Roma en la primera mitad del siglo XVIII, construyendo algunos de los mejores instrumentos de la época.
[5] Otros instrumentos singulares son los laúdes de arco que datan del siglo XVI y la espineta flamenca de 1623.
Cuenta con una sección etnográfica donde se presentan instrumentos provenientes del centro y sur de Italia, Europa continental, África central, Medio Oriente y el Lejano Oriente, que son de particular interés.