El Museo se encontraba originalmente en el Palacio del exgobernador hasta su traslado en 1997.
[1] Desde entonces, ha sido trasladado a la antigua Escuela para mujeres Hermanas Comboni.
La función del Museo Nacional de Eritrea es promover la historia de Eritrea y exhibirla al pueblo de Eritrea.
Además, es investigar nuevos sitios arqueológicos y explorar la historia de Eritrea.
En 1996, Eritrea nominada algunos de estos cinco sitios que deben ser considerados por la UNESCO como Patrimonio de la Humanidad: Adulis, Dahlak Kebir, Matara, Nakfa, Qohaito.