Juega como lateral izquierdo en el Club Atlético Colón de la Primera Nacional, a préstamo desde Estudiantes de La Plata.
Nicolás Fernández se inició en Estrella de Jeppener y tuvo un breve paso por Lanús, antes de incorporarse a las divisiones inferiores de Estudiantes de La Plata en 2013.
[1] El 22 de abril de 2022 tuvo su bautismo en Primera División, ingresando a los 83 minutos en el empate 2-2 contra Colón.
[2] En noviembre de 2022, firma su primer contrato profesional.
En septiembre de 2024, fue cedido a préstamo por 18 meses al Club Atlético Colón de la Primera Nacional.