Participó en la Guerra greco-italiana y en la Batalla de Grecia, sirviendo para las fuerzas armadas del Gobierno griego en el exilio.
También completó sus estudios en la Escuela de Artillería del Ejército de los Estados Unidos en Babenhausen en Alemania Occidental, y estudió también Económicas y Ciencias Políticas.
Cuando Papadopoulos intentó democratizar lentamente el régimen en 1973, nombrando al civil Spiros Markezinis como primer ministro, Makarezos fue destituido de su cargo en el gobierno.
Junto con otros líderes de la junta, fue juzgado por traición y rebelión y encontrado como culpable a sentencia de muerte], que posteriormente fue conmutada por cadena perpetua.
Desde 1990, Makarezos fue liberado de la cárcel por razones médicas en sucesivos permisos temporales, pero fue confinado en su casa.