En 1997 batió la plusmarca mundial junior de los 1500 m en Mónaco, pero no fue homologado debido a un defecto de forma, ya que no le hicieron pasar el control antidopaje.
Su revelación internacional se produjo en 1999, cuando fue 2º tras el marroquí Hicham El Guerrouj en la prueba donde este batió la plusmarca mundial de la milla con 3:43,13 en Roma.
Ya en los Juegos Olímpicos de Sídney, Hicham El Guerrouj era otra vez el gran favorito en los 1500 m, pues solo había perdido una carrera en los últimos cuatro años.
El Guerrouj y Ngeny lideraban la prueba por este orden en la última vuelta.
Ese mismo año sufrió un accidente de coche que le provocó una lesión crónica en la cadera.