Junto a Shuji Terayama y Donald Richie inició varios proyectos de cine experimental.
Junto a la técnica stop-motion, usó montajes en los que acelera y desacelera los planos con los que sus cintas adquieren dinamismo, esta técnica la aplicó en Mokuyoubi (1961), Katami (1963), Nakasendo (1963) y en Onomichi (1963) una serie de tema paisajístico.
Durante esta etapa empleó además técnicas como el montaje fragmentado, música pop inspirado en el fotograba parpadeo.
Esta etapa finaliza con Confession en 1968, en el que el director pasó una periodo de diez años sin rodar.
La película fue encargada por la productora Toho en 1975, quien le propuso rodar fuera del circuito comercial convencional.