La creación de la oficina fue también aplaudida por secretario general de las Naciones Unidas, António Guterres, quien había propuesto previamente transferir ciertas funciones del Departamento de Asuntos Políticos (DPA), incluyendo el Grupo de Trabajo contra el Terrorismo y el Centro contra el Terrorismo de Naciones Unida a esta nueva Oficina.
El secretario general considera la lucha contra el terrorismo y la prevención del extremismo violento como unas de las mayores prioridades de las Naciones Unidas contra una amenaza creciente para la seguridad y la paz internacionales.
Por tanto, espera que esta reforma contribuya a los esfuerzos más amplios de la ONU para promover la prevención de conflictos, el desarrollo y la paz sostenibles».
La oficina trabaja en estrecha colaboración con los Estados miembros de la ONU, las entidades de la ONU, la sociedad civil, las organizaciones internacionales y regionales, el mundo académico y otras partes interesadas para fortalecer las asociaciones existentes y desarrollar nuevas para prevenir y combatir el terrorismo de manera eficaz.
La ONUCT se estructura en los siguientes órganos de gobierno: