Fernández estudió en el Instituto Nacional de Música, siendo alumno de Antônio Francisco Braga, Frederico Nascimento y Henrique Oswald.
En 1923, Nascimiento se enfermó de gravedad y Fernández fue nombrado como su substituto temporal en la cátedra de armonía.
Dos años más tarde, fue nombrado permanentemente en el puesto.
Fernández compuso Malazarte, una ópera en tres actos con un libreto de Graça Aranha.
Además de esta ópera, Fernández también compuso un ballet, dos sinfonías, cinco poemas sinfónicos, dos suites para orquestra, un concierto para piano y otro para violín, cerca de 80 composiciones para piano y 36 canciones.