La prelatura territorial de Klaipėda (en latín: Praelatura Territorialis Klaipedensis y en alemán: Prälatur Memel) fue una circunscripción eclesiástica de la Iglesia católica en Lituania.
La prelatura territorial tenía 2657 km² y extendía su jurisdicción sobre los fieles católicos de rito latino residentes en el Territorio de Memel (llamado región de Klaipėda por Lituania).
El Territorio de Memel, junto con otras zonas escindidas de Alemania (el Sarre y la Ciudad Libre de Dánzig), permanecerían bajo el control de la Sociedad de las Naciones hasta el eventual momento en que estas comunidades votasen por su reintegración a Alemania o no.
La prelatura siempre fue administrada por los obispos de Telšiai, a excepción del período de la Segunda Guerra Mundial, cuando el administrador apostólico era el obispo de Varmia.
Según el Anuario Pontificio 1991 la prelatura territorial tenía a fines de 1990 un total de 120 000 fieles bautizados.