Preludio y fuga en do menor, BWV 546

[1]​ Como la mayoría de sus otros preludios y fugas para órgano, no se conserva ninguna partitura autógrafa, siendo la partitura más antigua conocida la copiada por Johann Peter Kellner, un conocido del compositor.

[3]​[4]​[5]​ Se cree que el preludio es el movimiento que presenta mayor madurez,[1]​ debido a las similitudes estructurales entre este movimiento y los preludios de órgano BWV 548 y BWV 544, los cuales muestran una construcción abigarrada e intrincada en forma de ritornelo-concierto.

Después del majestuoso diálogo inicial, la obra se ve pronto inundada por una serie de tresillos que se entrelazan con un segundo tema, repitiéndose el original sólo en fragmentos hasta su final.

[8]​ Parece ser que la fuga en alla breve se escribió durante la época que Bach pasó en Weimar y se le añadió el preludio luego, durante su estancia en Leipzig.

Hay quien piensa que el movimiento pudo haber sido compuesto parcial o totalmente por Kellner.