Pumas Morelos

Los responsables de las fuerzas básicas del Club Universidad serían los creadores de la filial: Guillermo Vázquez Mejía, Guillermo Vázquez y David Patiño, el proyecto sería aceptado por la Federación Mexicana de Fútbol en el verano del mismo 2006, Pumas fue el segundo equipo en la historia del balompié mexicano en tener un equipo filial en la Primera División "A" (Segunda División).

Todo se vino abajo cuando los procesos de los jugadores en el equipo se aceleraron, ya que el presidente del patronato Victor Mahbub, tras el campeonato del Clausura 2011, decidió reforzar el primer equipo de Pumas en la recién creada Liga MX, sólo con canteranos, por lo que eso fue prácticamente un golpe brutal para el conjunto morelense, los subidos al primer equipo eran la columna vertebral del cuadro en el Ascenso MX.

El 2012 fue el año en que Pumas Morelos sufrió más, pues la llegada de un nuevo patronato que decidió gastar el dinero en la compra de refuerzos en el primer equipo, dejando descuidado a la escuadra en Morelos, pues mantener a dos escuadras para dos torneos y reforzar al conjunto del Ascenso fue imposible.

Pumas Morelos no tuvo el visto bueno tras la llegada en marzo del 2012 de Jorge Borja Navarrete a la presidencia del equipo, y del Vicepresidente Deportivo del Club Universidad Nacional, Alberto García Aspe, quien consideró que la filial de Morelos era un gasto innecesario, ya que Pumas atravesaba por una severa crisis económica y aconsejó vender la franquicia, tras los malos manejos de la administración de Víctor Mahbub y la encabezada por Jorge Borja.

[3]​ Quienes llegaron a un acuerdo con Alberto García Aspe y Jorge Borja para su transacción por medio AMRH International.