El balneario se encuentra situado en la zona sureste del departamento de Rocha, sobre las costas del océano Atlántico, al noreste de La Paloma.
La zona comprendida entre La Paloma y Cabo Polonio, donde se ubica Punta Rubia fue fraccionada en la década de 1940.
Esta población incluye a la del balneario Santa Isabel de la Pedrera.
Además de sus playas, el balneario se destaca por las formaciones conocidas como Cárcavas de Punta Rubia, son socavones producidos en rocas y suelos, pertenecen a la formación Chuy, y muestran pronunciados barrancos y sectores muy erosionados.
Se trata de una zona conformada hace 140.000 años que alberga fósiles, vértebras de gliptodonte y diferentes elementos empleados por los indígenas que habitaron la costa.