El río Arinos nace en la sierra Azul,[1] una modesta línea de colinas que se encuentra a 180 km al noreste de Cuiabá.
Recibe al río Novo, un pequeño afluente más largo que él, y entonces toma dirección noroeste, casi rectilínea, y desemboca en el río Juruena, cerca de la pequeña ciudad del mismo nombre, después de recorrer 710 km (750 km si se considera la fuente del río Novo).
Las principales ciudades atravesadas por el río son Juara (35.000 habitantes), Novo Horizonte do Norte (3.760 hab.)
El Arinos es un río importante que a veces, incorrectamente, se considera como la principal fuente del río Tapajós; no lo es ni por longitud, ya que el São Manuel (o Teles Pires) es más largo que el Juruena-Arinos, ni lpor volumen, ya que el caudal medio del Arinos es significativamente menor que el del Juruena en la confluencia (1.350 m³/s y 2.300 m³/s respectivamente).
En las partes media y baja corren paralelaos a él las montañas de la serra dos Caiabis y de la serra do Tombador.