El río nace cerca del lago Buenos Aires y viaja 615 km a través de la Patagonia para desembocar en el océano Atlántico.
[1] El cauce se interrumpe en algunas partes al infiltrarse las aguas, formando un cauce seco o aflorando en algunos lugares generando pequeños manantiales (Cavallero, 2000).
El cauce es meandroso, con un alto contenido de sedimentos en suspensión incluso hasta el tramo central de la ría Deseado (Isla, 2004).
Su régimen hídrico presenta dos crecidas anuales, asociadas al máximo de precipitaciones durante el otoño-invierno y al deshielo durante la primavera, lo que determina un carácter estacional intermitente.
La desembocadura con el océano Atlántico, da como resultado la formación de la ría Deseado, un estuario con gran importancia biológica declarado Reserva Natural Provincial.