Un total de 36 afluentes desembocan en el Flinders,[6] siendo los principales los ríos Cloncurry, Saxby y Corella.
[5] Otros afluentes más pequeños son los arroyos Range, Morepork, Oxley, Canterbury, Dutton, Back Valley, L-Tree, Gorman, Hazlewood, Nonda, Eurimpy, Yambore, Bynoe y Armstrong.
[10] La vegetación a lo largo del río en la cuenca alta incluye bosques ribereños compuestos, que incluyen cortezas de papel; Melaleuca argentea, Melaleuca bracteata y Melaleuca fluviatilis y eucaliptos subdominantes, incluida la goma roja del río, Coolabah y en menor medida, Bauhinia.
[11] El sotobosque está dominado por una cubierta cerrada de pastos ribereños que incluye un lecho nativo en las franjas arenosas adyacentes a los canales del arroyo.
Los propietarios tradicionales de la zona son los pueblos Kalkadoon, Mitakoodi, Kukatj, Guthaarn, Mayi-Yapi, Mayi-Kulan, Mayi-Thakurti, Ngawun, Wanamara, Mbara, Yirandali y Gugu-Badhun, que han habitado la zona durante miles de años.
[12] El primer pastor de ganado en el país a lo largo del Flinders fue James Gibson, quien estableció la Estación Prairie en 1861.
[12] Grandes inundaciones ocurrieron a lo largo del río en julio de 1870.
El aumento del agua también causó devastación a los agricultores con grandes pérdidas para los rebaños de ganado.