En 1986 acudió a la Universidad de Western Ontario, donde se licenció en Filología Inglesa, para posteriormente obtener una maestría sobre Teoría y Crítica.
Tras completar su formación universitaria con un doctorado en Filosofía en la Universidad de Vanderbilt, se trasladó a London (Ontario) para finalizar su tesis, titulada Verdad y Contexto.
Actualmente sigue residiendo allí con su novia Sharron y su gato Scully.
Inicialmente, escribir solo era un hobby, una forma de relajarse cuando los estudios comenzaban a agobiarle.
R. Scott Bakker ha escrito también un thriller de ciencia ficción titulado Neuropath (Neurópata, 2008).