Sin embargo, desde este lugar en el dial, la programación de Radio María era únicamente escuchada en Lima.
Como sus hermanas, Radio María Perú transmite producciones de contenido cristiano.
Se reserva varios espacios para la oración, teniendo amplios espacios para el rezo del rosario (tres coronas al día), la misa diaria –transmitida desde diversas parroquias en toda el Perú– y la Liturgia de las Horas (laudes, vísperas y completas) sí como el rezo de la Coronilla de la Divina Misericordia y el angelus o el Regina Coeli según el tiempo litúrgico.
Emiten también el programa Haciendo Iglesia, con información de las actividades eclesiales que se van realizando en el Perú.
Por su filiación a la Familia Mundial, RM Perú emite algunos programas de otras Radio Marías, como Teología espiritual desde Colombia, así como algunas coproducciones a nivel Latinoamericano, como el Santo Rosario Hispanoamericano o Agenda eclesial de Iberoamérica.