Este juego expande en las mecánicas del primer Raiden, introduciendo dos armas: el Plasma Curvo, un arma de fijación de mira que genera daño bajo constante a enemigos, y la Bomba Cluster, una bomba de despliegue rápido que genera menos daño que las bombas regulares pero golpea un área más grande.
Misiles y armas primarios son disparados simultáneamente.
Las bombas son armas especiales que generan daño sobre una área amplia y cancelan el fuego de enemigo.
Tres años después que el VCD repelió la invasión de los Cristales, los restos de las máquinas controladas por los Cristales se reagruparon para formar otro ejército para continuar tomando la Tierra.
Raiden II era adaptado a Windows por Kinesoft y la Microsoft Corporation.