[4] Este trazado fue contestado por los militares, que acreditaban que, al pasar tan cerca de la frontera, crearía problemas en la defensa del país.
[5] No obstante, la compañía pasó por varios problemas de orden financiero, lo que imposibilitó concluir las obras, por lo que el estado abrió varios concursos para acabar las líneas.
[3][4] Con el Plan de la Red Ferroviaria al Sur del Tajo, documento oficial, publicado en 1902, con los proyectos ferroviarios de la región al Sur del Río Tajo, el trazado fue modificado, teniendo el lugar de enlace en la Línea del Este en el tramo de Crato a Elvas, debiendo la línea pasar por Vila Viçosa;[6] fue además creada una línea alternativa, entre Évora y Ponte de Sor, en la Línea del Este, que solo fue construida hasta Mora, en 1908.
[14] En ese mes, el ramal ya se encontraba construido,[15] y, en julio, una comisión técnica examinó el ramal, desde la antigua estación de Estremoz en Ameixial hasta Vila Viçosa, declarándolo en correctas condiciones.
La construcción del ramal fue, generalmente, bastante fácil, sin ninguna obra de ingeniería de grandes dimensiones, habiendo surgido escasas dificultades en el corte de una trinchera, debido a la dureza de la piedra que la conformaba; los materiales de vía para el tramo entre Estremoz y Vila Viçosa vinieron por ruta, siendo utilizada una aplanadora para el asentamiento.