Ahí conoció a la mexicana María Andrea del Rosario Luisa Rita Ignacia Schneider Castro (1838-?
De este matrimonio nacieron tres hijos; Lucas, Alfonso y Carmen Alamán Borneque.
El presidente Porfirio Díaz fue testigo del enlace, el cual fue presidido por el arzobispo de México.
Del matrimonio León de la Barra Borneque nació un hijo, Carlos.
Pese a las tragedias personales, la pareja vivió feliz hasta la muerte del licenciado León de la Barra, acontecida en 1939.