Günther ingresó a las SA en 1929, apenas con 16 años de edad, por lo que Adolf Eichmann lo consideraba "la personificación de la dureza".
Su despacho se hallaba en las oficinas principales de la Sección IVB4, en la Kurfürstenstrasse 116, Berlín, teléfono 25 9251.
En sus memorias, Rudolf Hoss afirmó que había podido concluir en la cifra de dos millones y medio de judíos exterminados en Auschwitz de acuerdo con la información provista a él por el General SS Richard Glücks, quien a su vez la había obtenido de Eichmann.
“Eichmann y su permanente delegado Günther fueron los únicos que poseyeron la información necesaria para calcular el número total de personas aniquiladas.” Hoss manifestó posteriormente que la cifra provista por Glücks era demasiado alta, lo que ha sido confirmado por historiadores e investigadores.
Rolf Günther es nombrado en el testimonio sobre las cámaras de gas del SS Obersturmführer Kurt Gerstein.