Fue también varias veces ministro durante los gobiernos de Manuel Isidoro Belzu, Jorge Córdova, José María Achá y Tomas Frías.
Años después y con el mismo gobierno sería nombrado prefecto del departamento de La Paz, algunos años más tarde y ya durante el gobierno del presidente Jorge Córdova, Carbajal se desempeñó como ministro de la Corte Suprema de Justicia en 1855.
No pasó mucho tiempo cuando meses después, en ese mismo año, el presidente José María Achá dejó la ciudad de La Paz para viajar al interior del país y dejando el mando del departamento de La Paz al prefecto Carbajal.
Carbajal no pudo controlar a Yañez ni la violencia que se desató en las calles durante esos días, saliéndole todo fuera de control y de su alcance.
Cabe mencionar que Frías puso a Carbajal en el ministerio porque este era un hombre que ya había permanecido anteriormente en ese mismo ministerio durante tres veces y tenía la suficiente experiencia además que su personalidad siempre fue honrada, de prestigio y versación en los negocios públicos.