Al sur se encuentra una zona de transición hacia la selva tropical, mosaico de selva y sabana.
La región del Sudd divide la sabana sudanesa oriental en dos bloques: Limita al norte con la sabana de acacias del Sahel, al este con la selva montana de Etiopía, al sureste con el mosaico de selva y sabana de la cuenca del lago Victoria, la sabana arbustiva de Kenia, la selva montana de África oriental y la selva montana de la falla Albertina; al sur con el mosaico de selva y sabana del norte del Congo, al oeste con la sabana sudanesa occidental y al noroeste con el mosaico del macizo de Mandara.
Entre las especies amenazadas se encuentran el elefante africano (Loxodonta africana), el licaón (Lycaon pictus), el guepardo (Acinonyx jubatus), el leopardo (Panthera pardus), el león (Panthera leo) y el eland de Derby (Taurotragus derbianus).
Los rinocerontes negro (Diceros bicornis) y blanco (Ceratotherium simum) eran nativos de esta ecorregión, pero han desaparecido debido a la caza excesiva.
Entre los vertebrados, sólo el ratón Mus goundae, el pinzón candela de Reichenow (Lagonosticta umbrinodorsalis), el tejedor de Fox (Ploceus spekeoides), el eslizón Panaspis wilsoni y la serpiente Rhamphiophis maradiensis.