San Antonio de Flores es un municipio del departamento de El Paraíso en la República de Honduras.
Era una aldea llamada "Los Llanos de Ibtipú".
Se le dio el actual nombre en honor a Antonio de Padua, santo de la Iglesia Católica y por la existencia de cantidad de flores en esta zona.
San Antonio de Flores está a 18 km de Texiguat y su cabecera cerca de la Quebrada El Camarón.
En 1886 (28 de octubre), era municipio del Círculo de Texiguat que pertenecía al Departamento de Tegucigalpa y ese año se agregó a El Paraíso.