San Francisco Lempa es un distrito del municipio de Chalatenango Sur del departamento de Chalatenango, El Salvador.
[1] El poblado comenzó a surgir a mediados del siglo XVIII, y para el año 1807, de acuerdo a un informe de Antonio Gutiérrez y Ulloa, era una "aldea de ladinos" del camino real hacia San Salvador, que comprendía "varios sitios en que están establecidas otras tantas familias de aquéllos; el añil es su principal fruto como en todo el Partido de Chalatenango, a que pertenece".
[2] Entre los años 1824 y 1835, perteneció al departamento de San Salvador; y de 1835 a 1855, al departamento de Cuscatlán; a partir de este último año ha sido municipio del departamento de Chalatenango.
En 1890 tenía una población de 730 habitantes.
El distrito tiene un área de 11 km², y la cabecera municipal una altitud de 300 m s. n. m.Las fiestas patronales se celebran en el mes de octubre en honor a San Francisco de Asís entre el 3 y 5 de Octubre y San Rafael Arcángel entre el 21 y 29 de Octubre.