El municipio se compone de dos áreas separadas: Fue fundado el 14 de enero de 1759 como una aldea con el nombre El Rincón del Mico y ubicada en la margen izquierda del Río Chichiguara.
Después sus habitantes se trasladaron al lugar donde hoy se encuentra, con el nombre de Santo Domingo.
En ese tiempo pertenecía al departamento de La Paz, pero en el año 1877 pasó a formar parte del departamento de Comayagua.
El Redondel de Arte Taurino José Marcial Salinas fue fundado en 1991.
El municipio cuenta con aguas termales: las Termas de San Sebastián.