Esta donación hacia 1030, indica que en las décadas anteriores existían ya estos lugares, que por el estado de roturación (se mencionan ocho "tierras", varios prados y viñas, además del rebollar de Valdazgo y la fuente sonna, todos ellos términos cuyos topónimos han pervivido en los últimos 1000 años en aquellos campos.
“Todos estos predichos términos pongo yo Sancho Rey bajo mi plena protección, de tal modo que ningún hombre pueda perseguir a enemigo alguno en estos términos antedichos y si los enemigos fuesen perseguidos en estos términos, pague el perseguidor 100 marcos de oro puro al rey de la tierra y al monasterio de Oña y que ningún hombre realice fuerza alguna en este lugar, (...) y todos los hombres que este lugar poblaren y donde habitaren u hoy día allí habiten o pueblen , no tributen sino al señor de Santa María, y no vayan en appellido (a la guerra de los nobles) y no paguen fonsadera (tributo por la defensa al alcaide de Herrera) y no vayan al fonsado, ni a la atalaya alguna y no paguen portazgo, ni agente del rey allí entre puesto que todo servicio y tributo han de hacerse al monasterio oniense y tenga libertad plena el monasterio de Santa María.
De la misma manera yo el rey, con mi mujer la reina Mayor, establecemos e confirmamos que ningún hombre pueda violaros o disminuiros nuestro privilegio.
En la cuarta columna confirma el conde de Saldaña y Carrión Gómez Díaz.
Posteriormente este monasterio desapareció, aunque fue recordado en su ermita que aun en el siglo XVI se conocía como una iglesia monasterial con un coto redondo a su alrededor que pasa a censo enfitéutico en 1502, con todos los diezmos y con su pila bautismal, la renta ha caído a 80 fanegas, Pero parece que hacia 1550 la granja decayó y la iglesia monasterial se arruinó dando paso a la ermita actual.
Otra planta posiblemente muy utilizada sería la rectangular de nave única y cabecera con testero recto.
Sobre el arco y en la zona del presbiterio hay restos de un artesonado policromado.
La descripción artística que acabamos de aportar, nos sitúa claramente en un templo prerrománico, datable en el siglo X o principios del XI.
A mediados del siglo XIV, contamos casi simultáneamente con dos fuentes importantes que nos ofrecen una fotografía bastante detallada.
El primero es San Miguel de Bamalúa que se encontraría en una terraza al Oeste del pueblo, que ha mantenido el pago el nombre de San Miguel, donde nace el arroyo del mismo nombre, y donde han permanecido corrales y majadas hasta fechas muy recientes.
Las tierras donde se asentaba este antiguo pueblo se adjudicaron finalmente a Villaprovedo, de la misma manera que las del despoblado de Villagonzalo, situado un poco más al Sur, lo fueron a Espinosa.
Este último casado con Doña Urbana Cossío y Bustamante.
Del siglo XVIII, pensamos que es la portada de la Casa Palacio próxima a la iglesia parroquial.
Y para mantener el aceite necesario para lucir la imagen de Nuestra Señora, se donó esta iglesia de la Lámpara, en el pago llamado entonces “al Sotillo”, situado en la Vega del Boedo.
Respecto a la estructura urbana, un estudio de la planta del pueblo, nos ofrece la impresión de que es posible que Santa Cruz tuviera una cerca en la Edad Media, apoyada por el levante y Sur por la terraza sobre la vega recorrida por los canales de riego y por el Norte, tras pasar las eras, apoyada por las casas y los corrales para el ganado, configurando una estructura característica que obras sobrevenidas en la actualidad no debieran pervertir o desvirtuar.
Este enclave del Valle del Boedo continúa siendo un lugar tranquilo y pintoresco, entre hurones y lazos, con el Boedo y los prados, con su estructura urbana de forma acorazonada que no debiera romperse, con el manantial de la ermita que sigue ofreciendo su agua, aunque en la actualidad haya que mejorar la fuerza de su conducción hasta el pueblo, recuperar viejos manantiales o buscar otros nuevos.
Puede que esto no sirva sino para que los paisanos sigan divisando su paso allende el río con cierta incredulidad en la distancia y los viajeros los vean fugazmente al pasar y admiren su adustez.
Entre los años 2008 a 2014 este ayuntamiento no ha tenido deuda viva.