Cermeño siguió luego la costa en dirección sur buscando un puerto seguro en que aventurarse con garantías, llegando a la actual bahía Drakes, donde ancló el 6 de noviembre.
(Este lugar, según algunas teorías, es el mismo New Albion en el que habría desembarcado el inglés Francis Drake dieciséis años antes).
A finales de noviembre, el San Agustín estaba anclado cuando una gran tormenta sopló del sur o suroeste.
Varias tripulantes se ahogaron (los relatos varían entre siete y doce), aunque la mayoría logró alcanzar la orilla.
En la isla San Martín, frente a la costa de la Baja California, fueron salvados al encontrar un pez varado lo suficientemente grande como para alimentarlos ocho días.
[1] Cermeño había hecho todo lo posible, pero el naufragio del San Agustín le privó de cualquier recompensa.