La Secretaría del Mercosur es el órgano que proporciona asesoramiento técnico al resto de los órganos del Mercosur.
Se estableció en 1994 a través del Protocolo de Ouro Preto.
Desde diciembre de 1996 se encuentra permanentemente en Montevideo, Uruguay.
[1] En su concepción original, el cuerpo fue creado sólo como un organismo operativo responsable de la prestación de servicios a los demás órganos del Mercosur.
Entre sus tareas se incluyen publicar y difundir las decisiones tomadas en el organismo, organizar los aspectos logísticos de las reuniones de los órganos del Mercorsur dentro y fuera de su sede, informar periódicamente a los Estados Partes sobre las medidas adoptadas por cada país para incorporar en su ordenamiento jurídico las decisiones adoptadas por los órganos del Mercosur previstos en el artículo 2 del Protocolo de Ouro Preto, como así también tareas indicadas por el Consejo del Mercado Común, el Grupo Mercado Común y la Comisión de Comercio del Mercosur.