El primer semestre del año se jugó los campeonatos provinciales, y en segundo semestre las Fases: Regional, Nacional y la Fase Final, cabe recordar que este sería el penúltimo torneo en jugarse como el segundo escalafón de la pirámide del Fútbol Ecuatoriano, es decir que hasta ese año el campeón ascendía a la Serie A, ya que debido al congreso de dicho año para la temporada de 1988 sería el último torneo en ser considerado como el segundo nivel ya que para la temporada de 1989, nuevamente se volvería a jugar la Serie B, y el torneo de Segunda Categoría regresaría a ser el 3° nivel del fútbol Ecuatoriano.
[1] El Juventus lograría su primer título que le daría la oportunidad de participar en el Campeonato Ecuatoriano de Fútbol 1988, mientras que el Calvi obtendría el primer subcampeonato.
Fase provincial (Primera Etapa) Fase regional (Segunda Etapa) Fase final (Tercera Etapa) Los equipos de Pichincha y Manabi Los equipos de Tungurahua y Cotopaxi.
Los equipos de Chimborazo y Esmeraldas.
Los equipos de Guayas y Azuay Los equipos de Los Ríos Clasificados como Primeros (Ganadores de cada Grupo) La disputaron entre Juventus y Calvi, ganando el equipo funebrero tras los 2 encuentros extras en dos terrenos neutrales jugados en Cuenca para el primer partido extra y Quito para el segundo partido extra.