El Campeonato Provincial de Segunda Categoría de Manabí 2020 fue un torneo de fútbol en Ecuador en el cual compitieron equipos de la Provincia de Manabí.
El torneo fue organizado por Asociación de Fútbol No Amateur de Manabí (AFNAM) y avalado por la Federación Ecuatoriana de Fútbol.
Participaron 6 clubes de fútbol y entregó dos cupos a los play-offs zonales de la Segunda Categoría 2020 por el ascenso a la Serie B.
Por efectos de la pandemia de coronavirus en Ecuador el número de equipos participantes se redujo al igual que las fechas de disputa del torneo se modificaron.
El sistema determinado por la Asociación de Fútbol No Amateur de Manabí fue el siguiente: Fuente: Aso ManabíCriterios de clasificación: 1) Puntos; 2) Diferencia de goles; 3) Goles marcados Fuente: Aso ManabíCriterios de clasificación: 1) Puntos; 2) Diferencia de goles; 3) Goles marcados