La Segunda División Peruana 1944, segunda edición del torneo, fue jugada por cinco equipos.
Se disputó desde finales de 1944 hasta mediados de 1945 y fue organizada por la Asociación No Amateur.
Respecto al torneo anterior, ningún equipo fue promovido o relegado en la Rueda de Promoción de 1943 y Jorge Chávez ascendió de la Liga Regional de Lima y Callao 1943.
El ganador del torneo, Ciclista Lima, fue promovido a la Rueda de Promoción contra el último de la Primera División de 1944, Sporting Tabaco, con el cual perdió y no logró ascender.
No hubo descenso.