Fue creada en el año 1994 y ese mismo año se afilió a FIBA África.
Originalmente, el equipo estaba programado para participar en la clasificación del AfroBasket 2017.
[1] En la clasificación del AfroBasket 2021, el equipo empezó fuerte ya que ganó sus primeros cuatro partidos.
Sin embargo, al final los ecuatoguineanos no se clasificaron debido a que perdieron por poco dos puntos en el duelo directo contra Guinea.
Resultado General: No ocupa puesto