La Selección de fútbol de Manipur es un equipo de fútbol de la India que juega el Trofeo Santosh, un torneo de fútbol a nivel regional de la India.
Fue fundado en el año 1973 en la ciudad de Manipur y es propiedad de la All Manipur Football Association.
Han clasificado al Trofeo Santosh en dos ocasiones, saliendo campeón en 2003 y llegando a la final en 2011, la cual perdieron.