Se mudó a Gran Bretaña y pasó varios años trabajando como asesor administrativo.
Shekhar Kapur inició su carrera en Bollywood, dirigiendo las películas indias Masoon (1983) y la cinta de ciencia ficción Mr.
En 1989 dirigió algunas escenas del film Joshilay, protagonizado por Sunny Deol, Anil Kapoor, Sridevi y Meenakshi Seshadri.
También estableció una compañía de películas indias junto a Ram Gopal Varma y Mani Ratnam.
También fue productor ejecutivo del musical de Andrew Lloyd Webber Bombay Dreams, que se presenta en Londres desde el 2002 y en Broadway desde el 2004.
En un papel poco usual, Kapur proporcionó la voz de Mahatma Gandhi en los libros de audio titulados The Story of My Experiments with Truth - autobiography of M. K. Gandhi, junto a Nandita Das como narradora.
Sus futuros proyectos incluyen las cintas Long Walk to Freedom, Water y The Last Full Measure.