Más tarde sirvió en el Servicio de Trabajo del Reich y se unió a la Wehrmacht en 1939.
Experimentó acción por primera vez durante la invasión alemana de Polonia, aunque dice que vio muy poco combate.
Tras ser gravemente herido por un disparo en la espalda, fue evacuado de Prusia Oriental a Fráncfort, donde fue capturado por los estadounidenses.
Se le negó la entrada a la Bundeswehr en 1956, pero encontró empleo en British Petroleum, limpiando minas plantadas por el Afrika Korps en el desierto del Sáhara durante la Segunda Guerra Mundial .
[1] Fue ascendido a capitán después de una exitosa operación para tomar Albertville (actual Kalemie) y dirigió el 52.º Comando, una pequeña subunidad del 5.º Comando compuesta por aproximadamente 53 soldados, desde julio de 1964.
[3] A medida que se difundían las noticias de las atrocidades cometidas por mercenarios en el Congo, Müller se convirtió en una figura odiada entre los socialistas y activistas estudiantiles de Alemania Occidental.