[3] La liga femenina es también organizada por la FEGUIFUT desde la temporada 2000-01, con una Primera y Segunda División.
Todos los equipos masculinos de Primera, Segunda y Tercera División, clasifican a la Copa de Su Excelencia, estando en una fase preliminar los de Tercera División que jugarán la fase preliminar entre sí a un solo partido y se clasificarán automáticamente los equipos vencedores a la siguiente fase, hasta encontrarse con los equipos de Segunda División, ocho equipos de Tercera División —cuatro por cada región— y cuarenta equipos de Segunda División —veinte por cada región—.
[9] Una vez acabada la temporada, la posición en la clasificación general determinará los ascensos y descensos, que previamente han sido establecidos por la FEGUIFUT.
En el caso de los ascensos, normalmente los primeros puestos asciende directamente.
[14] El fútbol femenino llegaría en la temporada 2000-01 denominada como Liguilla Nacional, entre 2008 y 2011 como Liga 1, de 2012 a 2014 como Campeonato Nacional hasta la actual Liga Femenina desde 2015.