En este juego, Sonic debe intentar escapar del laberinto creado por el Dr. Eggman con su velocidad habitual muy mermada.
Sonic the Hedgehog se encuentra a su paso por cada fase algunos tipos de enemigos, conocidos como Badniks.
Los Badniks son los robots que funcionan gracias al movimiento de animales atrapados en su interior, los cuales han sido capturados por el Doctor Robotnik, y los hay de diversos tipos: acuáticos y terrestres.
Son: Sonic puede obtener una serie de objetos que le ayudaran a completar el juego.
Dependiendo de cual se haya quedado al ponerse Sonic en esa parte, obtendrá una ventaja u otra: Anillos: estos aparecen solo durante las batallas con Eggman, incluyendo también el descenso por la rampa, y la fase de bonificación.
El jefe final es una especie de concha marina gigante, que suelta una perla para intentar atacar a Sonic.
El jefe final se divide en dos fases: La primera es el Doctor Eggman en su nave, que lanza bombas donde esté Sonic.
La segunda y última fase es la cara de Eggman solo, que expulsa un diente al suelo para intentar dañar a Sonic.
Solo hay una, y se accede desde el acto tercero de la fase Labyrinth of the Sea.
Sonic accederá así a un interruptor que debe activar, y luego puede entrar en la puerta titulada "Bonus".
También se incluyó en el recopilatorio Sonic Mega Collection Plus lanzado para PlayStation 2 y Xbox, aunque en este caso, está disponible desde un principio.