[4] La especie S. ophthalmica fue descrita por primera vez por el zoólogo británico Philip Lutley Sclater en 1860 bajo el nombre científico Spermophila ophthalmica; su localidad tipo es: «Babahoyo, Los Ríos, Ecuador».
[2] El nombre genérico femenino Sporophila es una combinación de las palabras del griego «sporos»: semilla, y «philos»: amante; y el nombre de la especie «ophthalmica» proviene del latín «ophthalmicus» que significa ‘de los ojos’.
[5] La presente especie (incluyendo las subespecies hoffmanni y hicksii) es tradicionalmente tratado como un grupo politípico de subespecies del semillero variable Sporophila corvina, sin embargo, las clasificaciones Aves del Mundo (HBW) y Birdlife International (BLI) consideran al este grupo de subespecies sureñas como una especie separada con base en notorias diferencias de plumaje y de vocalización.
[6][7] Esto no ha sido todavía adoptado por otras clasificaciones.
[7] Según la clasificación Clements Checklist/eBird v.2019 se reconocen tres subespecies en el grupo politípico ophthalmicus, con su correspondiente distribución geográfica:[3]