Aunque los especímenes tienen un fuerte parecido con los huesos de S. junggarensis, no han sido asignados a ninguna especie.
[1] Otra especie, S. shunanensis, fue descrita en 2005 en depósitos del Jurásico Medio de Zigong en Sichuan, China.
El cráneo es más ancho en la parte posterior en vez de entre los ojos, un rasgo solo visto en S. shunanensis.
[2] Sunosuchus fue clasificado inicialmente como un folidosáurido debido a que sus mandíbulas alargadas lo vuelven un crocodiloforme longirrostrino.
A pesar de sus similitudes con los folidosáuridos, Sunosuchus comparte varios rasgos con los goniofolídidos que lo incluyen en este grupo.
Sin embargo, estos rasgos pueden ser considerados como plesiomórficos dentro de Mesosuchia, el grupo al cual pertenecen tanto los goniofolídidos como los folidosáuridos.
Estas áreas compartían una fauna similar caracterizada por crocodiliformes como Sunosuchus así como anfibios temnospóndilos y tortugas xinjiangquélidas, indicando que había ecosistemas de agua dulce por la región.